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城都联盟
若叶镇，吹起开始之风的城镇！
9投手的菊草叶
20赫拉克罗斯对抗大甲（小智收服赫拉克罗斯）
2顿甲之谷
22咕咕跟迷惑森林
2美丽花的战斗之舞
24线球大搜索线
25布卢的华丽生活
26惊角鹿，幻影森林
27好胜的菊草叶（小智收服菊草叶）
2沼王和gs球
29芭瓢虫之笛
0幸福蛋的快乐护士
喇叭芽之塔大危机
2桔梗道馆，空中大战（小智得到飞翼徽章）
爱哭鬼玛力露
4暴走，尾立和波克比
5再见了喷火龙，直到下一次重逢！（小智的喷火龙离队）
6向日花怪会场大恐慌
7菊草叶不高兴了
毽子草飞跑了！大草原之战！
9神秘超级英雄，天蝎人登场
40咩利羊和牧场的少女
4巨钳螳螂对抗赫拉克罗斯
42收服火球鼠（小智收服火球鼠）
4桧皮镇的呆呆兽之井
44榛果球与圆柑果实，后山之战！（小刚收服榛果球）
45桧皮道馆，森林的战斗场地（小智得到昆虫徽章）
46黑暗森林，寻找大葱鸭
47果然翁与神奇宝贝交换会（武藏的大舌头交换到果然翁，小智的肯泰罗归队，赫拉克罗斯离队）
4杰尼龟队燃烧斗志！像火一样（小智的杰尼龟、肯泰罗离队）
49好多乌波
50胖丁对抗布卢
5黑暗神奇宝贝，戴鲁比
52小锯鳄是谁的？小智对抗小霞（小智收服小锯鳄，小霞的蚊香蝌蚪进化成蚊香蛙）
5对抗盔甲鸟，钢翼
54小锯鳄，跳出爱的舞步
55抓到漂亮的猫头夜鹰（小智收服猫头夜鹰）
56圈圈熊吓死人
57麒麟奇，超能力神奇宝贝之村
5占卜大混战
59满金道馆，速度与力量
60大奶罐，复仇之战（小智得到正式徽章）
6收讯塔的战斗，超越时空
62捕虫大会在自然公园收服他！
6胡说树在哪里？
64古代神奇宝贝公园阿露福遗迹
65**屋的传信**
66超音蝠之馆危险的迷宫（小刚的超音蝠进化大嘴蝠）
67柯波朗对抗妙蛙种子格斗大对决
6丛林的三只温泉战斗
69金鱼王，钓鱼战斗
70再见了六尾，神奇宝贝选美大赛（小刚的六尾离队）
7壶壶对抗喇叭芽
72月精灵黑夜里的战斗
7安飘虫超越风之谷
74果然翁之村
75百变怪大师，与伊美蒂重逢
76喵喵跟布卢跟布卢皇
77阿利多斯，忍术战斗
7展翅吧，阳阳玛，飞向明天的天空！
79皮卡丘与皮丘
0毽子花，草系神奇宝贝的战斗
黑鲁加跟波克比
2烧焦塔，小松登场
圆朱道馆，鬼斯战斗（小智得到魅影徽章）
4伊布五姐妹，茶会大战斗
5黑暗鸦，被夺走的徽章
6铁炮鱼的天空
7熊宝宝的秘密
冻僵的向日种子之迷
9挖这里，小山猪，寻找温泉
90急冻鸟vs胖丁，暴风雪之中
9风速狗与火之石
92土龙弟弟全都没了
9果然翁遇难了
94小刚晕倒？危险的露营事件！
95大力鳄抵抗水箭龟相扑大战斗（小智的猫头夜鹰本集离队后归队，卡比兽本集归队后离队）
96与神奇宝贝讲话神奇宝贝的语言神奇宝贝的心情
97大嘴蝠对假面女王武藏遗迹之战（小刚的大嘴蝠进化成叉字蝠）
9图图犬的遗迹旭日中的光辉
99尼多力诺和尼多娜，小刚的玫瑰生活
再见了菊草叶，电气的迷宫（小智的菊草叶进化成月桂叶）
20月桂叶到哪里去了？在药草园抓住它！（月桂叶学会泰山压顶）
天然雀的占卜预测未来的神秘
20神奇宝贝气球大赛越过暴风雨
204迷唇娃迷死人超级巨星喜欢神奇宝贝
踏浪追踪铁甲暴龙！湖之战！
206变隐龙在哪里？不见的神奇宝贝，大混乱
207讨厌水系神奇宝贝的乔伊小姐，小霞的愤怒
20圣母大奶罐，沙漠的秘密
209光辉灯塔！浅葱市的战斗
20湛蓝道馆，正面决斗，格斗大对决（小智得到打击徽章）
2漩涡列岛，新的挑战！
22**与大**，飞向未曾见过的天空！
2向大海出发吧，灯笼鱼大游行
24太阳珊瑚好朋友！黄岩岛的对决（小霞收服太阳珊瑚）
25巨翅飞鱼跟沉船，神秘神奇宝贝的秘密
26章鱼桶跟铁炮鱼！漩涡列岛大赛预赛！
27漩涡列岛大赛，在水的运动场大战斗！
2小智对抗小霞，漩涡列岛大赛最后的战斗！
29保护地鼠的村子，陷阱大作战
银色之翼的传说，银岩岛的战斗！
22神秘的神奇宝贝
被抓走的洛奇亚！
22与洛奇亚的约定
224飞吧咕咕号！以浅葱市为目标！
浅葱市vs大钢蛇（小智得到钢铁徽章）
226再见妙蛙种子！大木家后院大冒险！（小智的妙蛙种子离队）
227太阳精灵与樱花！再次回到圆朱市！
22水君与米那基！凤王的传说！
229在神奇宝贝劲速赛中向前冲！（小智得到蛋）
20名侦探君莎，蛋不见了，大解谜
2蛋要孵化了（小智的蛋孵化成小小象）
22火箭队跟信使鸟
2雾中的九尾
24巴尔郎与空手道王信彦
25天然鸟的大预言
26渡与红色暴鲤龙
27红色暴鲤龙的愤怒
2长毛猪与冬天的柳伯
29卡吉道馆，冰之对战（小智得到冰之徽章）
240美丽花vs霸王花！草原的和平
24熔岩蜗牛，用火热的心来收服！
242神奇宝贝魔法大变身
24闪电鸟跟水晶，湖的秘密
244双胞胎的宝宝丁对抗胖丁
245呆呆兽之悟，小智之悟
246真假大木博士，神奇宝贝川柳对决！
247皮宝宝跟皮皮跟流星
24蚊香蛙的进化（小霞的蚊香蛙进化成牛蛙君）
249竞技公园vs水箭龟、喷火龙、妙蛙花
牛蛙君跟拉拉队
25冰之洞窟
桩与迷你龙
25烟墨道馆的龙之牙
254快龙！逆鳞立起！（小智的喷火龙归队）
烟墨道馆！最后的徽章（卡比兽归队，喷火龙离队，小智得到升龙徽章）
256道馆徽章与小果然翁
257龙宫道馆，水中之战
25乘龙之歌（小智与乘龙重逢，并被托付一颗蛋）
259保护神秘蛋！在暴风雨中诞生新生命（蛋孵化成由基拉）
260炎帝与温泉的伙伴（小刚的榛果球进化成佛烈托斯）
26河马王，王者的信物！
262奈奈与电击怪（小次郎的大食花交换到口呆花，口呆花进化成大食花，大食花离队）
26加油吧！由基拉
264不可思议的未知图腾
265班吉拉与由基拉（由基拉离队）
266狃拉与圣火
267白银大会！与小茂再度重逢！
26联盟预赛！火岩鼠火焰战斗！
269大菊花vs妙蛙种子草系神奇宝贝的尊严
270决胜淘汰赛全体战斗6vs6
27劲敌对决！水箭龟vs喷火龙！
272遭遇火焰鸡！与叶越的对决！
27全力战斗之后!!各人的道路!！（小智止步白银大会强）
274再见和启程（小刚，小霞离队，小智的除皮卡丘以外的神奇宝贝都寄放在大木研究所）
275和皮卡丘的分离